เนื้อเรื่องภาคนี้จะย้ายไปที่สหภาพยุโรป(E.U.) ที่กำลังทำสงครามกับจักรวรรดิบริททาเนียอย่างเมามันส์โดยทหารที่รบอยู่ในยุโรป มีอีเลฟเว่นอยู่ด้วย แต่เนื่องด้วยที่ญี่ปุ่นถูกยึดเป็นอาณานิคมแล้วยังแพ้สงครามการปฏิวัติของซีโร่ ทำให้สถานะของอีเลฟเว่นในกองทัพEUตกต่ำลงอย่างมาก-สาธารณรัฐยูโรเปีย ที่ราบ132 ซึ่งเป็นจุดยุทธศาสตร์สำคัญ ถูกกองทัพบริททาเนียปิดล้อมชาวอีเลฟเว่นถูกสั่งให้ไปประจำการที่ที่ราบ132 โดยที่ไนท์แมร์เฟรมอเล็กซานเดอร์นั้นจะติดตั้งระบบทำลายตัวเองไว้สำหรับทำคามิคาเซ่ เวลาเครื่องถุกโจมตีเสียหายหนัก หรือคนขับใกล้ตาย